Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Copb1Q9JIF7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms