Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird1Q9JI57 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms