Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcirg1Q9JHF5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms