Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim2Q9ESN6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim2Q9ESN6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms