Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN4

C1ql3, Complement C1q-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1ql3Q9ESN4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1ql3Q9ESN4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql3Q9ESN4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql3Q9ESN4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql3Q9ESN4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1ql3Q9ESN4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms