Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Rb1cc1Q9ESK9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
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Rb1cc1Q9ESK9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
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