Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtofQ9ESF1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtofQ9ESF1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtofQ9ESF1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
OtofQ9ESF1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
OtofQ9ESF1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
OtofQ9ESF1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
OtofQ9ESF1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtofQ9ESF1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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