Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc4Q9ES56 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms