Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slco1c1Q9ERB5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms