Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snap29Q9ERB0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap29Q9ERB0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms