Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tfip11Q9ERA6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms