Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Clstn2Q9ER65 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clstn2Q9ER65 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms