Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rapgef4Q9EQZ6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rapgef4Q9EQZ6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms