Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cyp3a44Q9EQW4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp3a44Q9EQW4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms