Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcnn1Q9EQR3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnn1Q9EQR3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms