Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SgshQ9EQ08 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms