Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf21Q9EPU5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms