Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp1aQ9EPL5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp1aQ9EPL5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms