Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Clstn1Q9EPL2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clstn1Q9EPL2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms