Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r53Q9EP93 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r53Q9EP93 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms