Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mrpl4Q9DCU6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms