Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnft1Q9DCN7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms