Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Csnk1dQ9DC28 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms