Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf6Q9DBU5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf6Q9DBU5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms