Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms