Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pop5Q9DB28 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pop5Q9DB28 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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