Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAV9

Tmem38b, Trimeric intracellular cation channel type B, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38bQ9DAV9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem38bQ9DAV9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem38bQ9DAV9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms