Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Asf1bQ9DAP7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Asf1bQ9DAP7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms