Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim23Q9DAL0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms