Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rsph3bQ9DA80 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms