Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Smco2Q9DA21 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms