Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn34b2Q9D9N2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cldn34b2Q9D9N2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34b2Q9D9N2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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