Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D9H8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D9H8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D9H8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D9H8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms