Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg7Q9D906 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms