Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U2

Tmem41a, Transmembrane protein 41A, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem41aQ9D8U2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem41aQ9D8U2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms