Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tvp23bQ9D8T4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tvp23bQ9D8T4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms