Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q9D8Q6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms