Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Alkbh4Q9D8F1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Alkbh4Q9D8F1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms