Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms