Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn22Q9D7U6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Cldn22Q9D7U6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Cldn22Q9D7U6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Cldn22Q9D7U6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Cldn22Q9D7U6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Cldn22Q9D7U6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn22Q9D7U6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms