Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Borcs8Q9D6Y4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms