Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Borcs6Q9D6W8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Borcs6Q9D6W8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms