Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J1

Cers4, Ceramide synthase 4, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers4Q9D6J1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers4Q9D6J1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cers4Q9D6J1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms