Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtl8cQ9D6I0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms