Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdr42e1Q9D665 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.1 ms