Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sec23bQ9D662 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec23bQ9D662 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms