Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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Rab11fip1Q9D620 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab11fip1Q9D620 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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