Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc81Q9D5W4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms