Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sf3a3Q9D554 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3a3Q9D554 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms