Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930513O06RikQ9D549 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930513O06RikQ9D549 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930513O06RikQ9D549 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930513O06RikQ9D549 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
4930513O06RikQ9D549 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
4930513O06RikQ9D549 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930513O06RikQ9D549 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms